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En la pared celular hay una sustancia, los antígenos del leucocito humano(HLA) que son reconocidos por el sistema inmunitario del receptor como extraños y el injerto es rechazado.
El rechazo se controla con medicamentos inmunosupresores, como la ciclosporina, pero el exceso de estos inmunosupresores puede aumentar el riesgo de infecciones oportunistas al estar disminuidas su defensas.
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